Dessiner vos plasmides

​ Visualisez vos séquences ADN de façon circulaire et linéaire.

​ Personnalisez vos vues  : choisissez vos groupes d'enzymes préférées, les noms de séquences, les oligonucléotides ou ORFs que vous souhaitez voir apparaitre sur la séquence ADN. 

​ Importez vos séquences de plasmides en .gb ou cipier/coller la séquence ADN.

​ Adaptez l'origine, éditez la séquence pour enregistrer des modifications sans erreurs (délétions, additions, substitutions) 

​ Utilisez les annotations automatiques : les séquences spécifiques sont automatiquement reconnues par le module et annotées sur le plasmide.

​ Liez les plasmides aux projets ainsi qu'à tous ses échantillons dérivés: préparation de plasmides, stocks glycérols, cellules, clones, protéines, aliquots, etc.. 

Vérifiez vos processus de clonage et évitez les erreurs

​ Les processus de clonage peuvent être simulés pour éviter les erreurs. Les inserts peuvent provenir de produits de restriction du plasmide, de synthèse d'ADN ou d'amplification par PCR.

​ Utilisez différents types de clonages: ligation classique, 'infusion', la recombinaison de la levure, ou le 'Golden Gate'.

 
​ La création de nouvelle carte de plasmide est automatique.

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​ Conservez l'historique de la construction.

Analysez vos résultats de séquençage 

​ Retrouvez toutes vos amorces dans la même table et trouvez automatiquement des informations telles que la température de fusion, la teneur en GC, la longueur, le poids moléculaire, etc.

​ Trouvez en un clic si vous avez déjà des amorces adéquates dans votre laboratoire. Si besoin, Yu-Clone vous aide aussi dans la conception d'amorces supplémentaires.

​ Comparez les résultats du séquençage à la carte de plasmide attendue. Yu-Clone aide à l'identification des mésappariements et permet une correction manuelle si nécessaire.

​ Remplissage automatique du "statut de l'analyse", en fonction des résultats du séquençage (invalidé, partiel, validé).

MoClo (Modular Cloning)

​Yu-Golden Gate vous aide à travailler avec les standards MoClo, Ecoflex mais aussi CIDAR, les standards pour la levure et les plantes. Il vous permet également de concevoir votre propre standard, avec la personnalisation des sites de fusion et des modèles d'assemblage. La cohérence de votre standard est vérifiée automatiquement.

​ Identification automatique des parties du Golden Gate dans vos plasmides

​ Obtenez en un clic toutes les 'parts' compatibles avec les sites de fusion spécifiques et les enzymes de restriction de type IIS.

​ Yu-Golden Gate trouve en 1 clic tous les vecteurs accepteurs compatibles à votre clonage. 

​ Yu-Golden Gate permet le clonage combinatoire in-silico et crée tous les pladmides que vous souhaitez en quelques clics.

​ Les volumes à prélever pour chaque 'parts'/plasmides sont calculés et prêts à être envoyés à votre robot de pipetage préféré.